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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
15/06/2023 |
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Data da última atualização: |
16/06/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
DECKER, J. E.; MCKAY, S. D.; ROLF, M. M.; ALCALA, A. M.; SONSTEGARD, T. S.; HANOTTE, O.; GOTHERSTROM, A.; SEABURY, C. M.; PRAHARANI, L.; BABAR, M. E.; REGITANO, L. C. de A.; YILDIZ, M. A.; HEATON, M. P.; LIU, W. S.; LEI, C. Z.; REECY, J. M.; SAIF-UR-REHMAN, M.; SCHNABEL, R. D.; TAYLOR, J. F. |
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Afiliação: |
JARED E. DECKER, University of Missouri; STEPHANIE D. MCKAY, University of Vermont; MEGAN M. ROLF, Oklahoma State University; ANTONIO MOLINA ALCALA, Universidad de Cordoba; TAD S. SONSTEGARD, USDA-ARS Bovine Functional Genomics Lab.; OLIVIER HANOTTE, University of Nottingham; ANDERS GOTHERSTROM, Uppsala Universitet; CHRISTOPHER M. SEABURY, Texas A&M University; LISA PRAHARANI, Indonesian Research Institute for Animal Production; MASROOR ELLAHI BABAR, University of Veterinary and Animal Sciences; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE; MEHMET ALI YILDIZ, Ankara University; MICHAEL P. HEATON, U.S. Meat Animal Research Center; WAN-SHENG LIU, University Park; CHU-ZHAO LEI, Northwest A&F University; JAMES M. REECY, Iowa State University; MUHAMMAD SAIF-UR-REHMAN, University of Agriculture, Faisalabad, Pakistan; ROBERT D. SCHNABEL, University of Missouri; JEREMY F. TAYLOR, University of Missouri. |
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Título: |
Worldwide patterns of ancestry, divergence, and admixture in domesticated cattle. |
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Ano de publicação: |
2014 |
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Fonte/Imprenta: |
Plos Genetics, v. 10, n. 3, e1004254, 2014. |
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Páginas: |
14 p. |
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DOI: |
10.1371/journal.pgen.1004254 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The domestication and development of cattle has considerably impacted human societies, but the histories of cattle breeds and populations have been poorly understood especially for African, Asian, and American breeds. Using genotypes from 43,043 autosomal single nucleotide polymorphism markers scored in 1,543 animals, we evaluate the population structure of 134 domesticated bovid breeds. Regardless of the analytical method or sample subset, the three major groups of Asian indicine, Eurasian taurine, and African taurine were consistently observed. Patterns of geographic dispersal resulting from co-migration with humans and exportation are recognizable in phylogenetic networks. All analytical methods reveal patterns of hybridization which occurred after divergence. Using 19 breeds, we map the cline of indicine introgression into Africa. We infer that African taurine possess a large portion of wild African auroch ancestry, causing their divergence from Eurasian taurine. We detect exportation patterns in Asia and identify a cline of Eurasian taurine/indicine hybridization in Asia. We also identify the influence of species other than Bos taurus taurus and B. t. indicus in the formation of Asian breeds. We detect the pronounced influence of Shorthorn cattle in the formation of European breeds. Iberian and Italian cattle possess introgression from African taurine. American Criollo cattle originate from Iberia, and not directly from Africa with African ancestry inherited via Iberian ancestors. Indicine introgression into American cattle occurred in the Americas, and not Europe. We argue that cattle migration, movement and trading followed by admixture have been important forces in shaping modern bovine genomic variation. MenosThe domestication and development of cattle has considerably impacted human societies, but the histories of cattle breeds and populations have been poorly understood especially for African, Asian, and American breeds. Using genotypes from 43,043 autosomal single nucleotide polymorphism markers scored in 1,543 animals, we evaluate the population structure of 134 domesticated bovid breeds. Regardless of the analytical method or sample subset, the three major groups of Asian indicine, Eurasian taurine, and African taurine were consistently observed. Patterns of geographic dispersal resulting from co-migration with humans and exportation are recognizable in phylogenetic networks. All analytical methods reveal patterns of hybridization which occurred after divergence. Using 19 breeds, we map the cline of indicine introgression into Africa. We infer that African taurine possess a large portion of wild African auroch ancestry, causing their divergence from Eurasian taurine. We detect exportation patterns in Asia and identify a cline of Eurasian taurine/indicine hybridization in Asia. We also identify the influence of species other than Bos taurus taurus and B. t. indicus in the formation of Asian breeds. We detect the pronounced influence of Shorthorn cattle in the formation of European breeds. Iberian and Italian cattle possess introgression from African taurine. American Criollo cattle originate from Iberia, and not directly from Africa with African ancestry inherited via Iberian... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Domesticated Cattle. |
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Thesagro: |
Bos Indicus; Bos Taurus. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1154456/1/WorldwidePatternsAncestry.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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| 4. | | BEHURA, S. K.; TIZIOTO, P. C.; KIM, J.; GRUPIONI, N. V.; SEABURY, C. M.; SCHNABEL, R. D.; GERSHWIN, L. J.; VAN EEnenNAAM, A. L.; TOAF-FROSENSTEIN, R.; NEIBERGS, H. L.; REGITANO, L. C. de A.; TAYLOR, J. F. Tissue tropism in host transcriptional response to members of the bovine respiratory disease complex. Scientific Reports, v.7, n. 17938, p. 1-15, 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 17. | | MCCLURE, M. C.; SONSTEGARD, T. S.; WIGGANS, G.; EENENNAAM, A. L. V.; WEBER, K. L.; PENEDO, C. T.; BERRY, D. P.; FLYNN, J.; GARCIA, J. F.; CARMO, A. S.; REGITANO, L. C. A.; SOUZA, M. A.; SILVA, M. V. G. B.; COFFEY, M.; MOORE, K.; BOSCHER, M. Y.; GENESTOUT, L.; MAZZA, R.; TAYLOR, J. F.; SCHNABEL, R. D.; MACHADO, M. A.; SIMPSON, B.; MCEWAN, J. C.; CROMIE, A.; COUTINHO, L. L.; KUEHN, L. A.; KEELE, J. W.; PIPER, E. K.; COOK, J.; MARQUES, E.; TASSELL, C. P. V. Imputation of microsatellite alleles from dense SNP genotypes for parentage verification across multiple bos taurus and bos indicus breeds. In: ANNUAL INTERNATIONAL PLANT AND ANIMAL GENOME CONFERENCE, 21., 2013, San Diego. Abstracts... San Diego: [s.n.], 2013.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 19. | | DECKER, J. E.; PIRES, J. C.; CONANT, G. C.; MCKAY, S. D.; HEATON, M. P.; CHEN, K.; COOPER, A.; VIKKI, J.; SEABURY, C. M.; CAETANO, A. R.; JOHNSON, G. D.; BRENNEMAN, R. A.; HANOTTE, O.; EGGERT, L. S.; WIENER, P.; KIM, J.-J.; KIM, K. S.; SONSTEGARD, T. S.; TASSELL, C. P. V.; NEIBERGS, H. L.; MCEWAN, J. C.; BRAUNING, R.; COUTINHO, L. L.; BABAR, M. E.; WILSON, G. A.; MCCLURE, M. C.; ROLF, M. M.; KIM, J. W.; SCHNABEL, R. D.; TAYLOR, J. F. Resolving the evolution of extant and extinct ruminants with hith-throughput phylogenomics. Proceedings of the National Academy of Sciences, v. 106, n. 44, p. 18644-18649, 2009| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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